故事舞臺發生在13年前,在東京秋葉原發生的6名少女離奇失蹤案件「秋葉原神隱」,最終以懸案告終。曾被譽為天才創作者的新城大輝,為迎接一年一度的遊戲展,宣布將以該事件為題材開發新作遊戲《AKIBA LOST》。然而發表後不久,大輝便接到一通威脅電話:「停止遊戲開發,否則悲劇將重演。」擔任遊戲參演者之一的大輝妹妹葵也被卷入事件,突然失蹤。大輝被迫面臨終極抉擇:是完成遊戲,還是守護妹妹與同伴?