故事講述了與妹妹壹起生活、就讀於都立來禪高中的主人公五河士道,過著平常的生活的他在四月十日遇上了壹場大爆炸,而在大爆炸之中出現了被稱作“精靈”的謎之美少女夜刀神十香。精靈是存在於鄰界的特殊災害指定生命體,其出現時會發生空間震,使周圍遭受到很大的災難。然而,過著平凡的生活的士道卻能阻止她摧毀地球,那就是要與她約會,就這樣故事正式拉開帷幕。