壹部軍用的機械人在無人的情況自動啓動、壹個名爲帆場瑛壹的篠原重工天才程序員自殺；誰也沒想到，兩起無關事件卻會在將來把東京帶入恐怖中。
東京各處陸續發生了壹系列機械人暴走的事情，經過特車2課的調查，發現可疑之處是壹套新推出的機械人操作系統：HOS，而該OS是篠原重工的作品。更爲嚴重的是眼下大部分的機械人都已更換爲此系統，所以後藤他們認爲潛在的危機是十分可怕的(如果東京內的大部分機械人壹起暴走，那麽東京就將毀滅)。但是沒有任何的證據證明機械人暴走與HOS有關，爲此後藤委托松井刑事協助調查。當調查到HOS主創人員帆場時，發現他早已把自己的過去資料抹去，唯有他的住處記錄還存在著。松井追隨著幾年來帆場所暫住的地方，卻驚異的發現帆場在這幾年內竟然搬過20幾次家，而每當線索帶著他們來到其中的某壹處地方時，那裏似乎都是被新時代建築所淘汰的過去回憶，時間的腳步仿佛已經開始在慢慢倒轉著。甚至松井也不禁在懷疑：難道是帆場瑛壹刻意帶著他來看到這些被人們遺忘的角落？他到底想告訴我們什麽？
同時，特車2課第2小隊的各位並沒有閑著，在繁夫的幫助下，他們似乎找到了機械人暴走的條件：當風速達到40米/秒時與建築物之間産生的共鳴，會使HOS中的隱藏功能對這個現象做出反映。而他們也意識到了：東京市內可以使所有機械人同時發狂的共鳴物，就是那個“巴比倫計劃”、那個高聳入雲的建築、那個代表著人類欲望與技術結晶的建築！此時電視傳來了氣象預報的聲音：“預計今夜風速達40米/秒的台風將登陸東京，請做好防範准備......”
